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  LES NUCLEOSIDES ET NUCLEOTIDES.Un nucléoside est une molécule formée soit d’un ribose soit d’un désoxy-ribose avec soit une base purique soit une base pyrimidique. La liaison se fait entre le carbone C1’ du pentose (ribose ou désoxy-ribose) et l’azote N9 de la base purique ou N1 de la base pyrimidique. Le pentose est sous la forme furanose et la liaison osidique est sous la forme b. Nomenclature des principaux nucléosides:
Exemples de nucléosides :
Un nucléotide (ou nucléoside-monophosphate) est un nucléoside avec un phosphate sur le carbone C5' du pentose, on parle aussi d'ester phosphorique de nucléosides.
Exemples de nucléotides :
STRUCTURE PRIMAIRE DES ACIDES NUCLEIQUESLes acides nucléiques ne sont ni plus ni moins que des polymères de nucléotides (nucléosides mono-phosphates). La liaison entre deux nucléotides successifs se fait grâce à des liaisons 3'-5' phosphodiester. Exemple: pApApAp  Lorsque que l'on écrit une séquence nucléotidique c'est toujours dans le sens 5'->3', ici le premier A de pApApAp est en haut et le troisième en bas. LA STRUCTURE SECONDAIRE DE L'ADNL'ADN est constitué de 2 brins d'acides nucléiques complémentaires et anti-parallèles.
L' hélice d'ADN peut avoir plusieurs configurations (formes) suivant la séquence et la concentration ionique des milieux :
La forme Z n'est en fait qu'une séquence alternée de C et de G : CGCGCGCG Vous pouvez voir ces 3 hélices en stéréographie sur le site : http://perso.wanadoo.fr/vincent.masson/stereographie.htm Une base reliée a un sucre peut être en position anti ou en syn, évidemment la position la plus courante dans l'ADN est anti.  Le sucre contient est un cycle à 5 atomes (4 carbones et 1 oxygène).Comme on a des carbones sp3(tétraédrique), le cycle ne peut pas être plan, il y aura toujours un atome au dessus du plan ou en dessous. En général c'est soit le C2' soit le C3' qui est en dehors du plan. Si l'atome est au dessus du plan on dit qu'il est en position endo, si il est en dessous du plan on dit qu'il est en position exo. On peut aussi avoir ces deux atomes en dehors du plan, un au dessus et l'autre en dessous. En général dans l'ADN on a un C2' endo et dans l'ARN un C3'endo.  Les plateaux de bases peuvent être décalés entre eux, c'est à dire non parallèles. Il existe 3 types de rotation d'un plateau de paire de bases par rapport à la normale : roulis, tangage et lacet.  LA STRUCTURE SECONDAIRE DE L'ARNL'ARN peut former une hélice identique à celle de l'ADN grâce à 3 liaisons H entre C et G et 2 entre A et U. La différence avec l'ADN est la présence d'un seul brin, et donc il peut se replier sur lui même, l'ADN par contre est formé de 2 chaînes. La plupart du temps on a des liaisons H dites Watson-Crick qui sont à l'origine des structures en tige boucle. Watson et Crick sont les biologistes qui ont découvert la structure en double hélice d'ADN en 1958.  On peut aussi avoir des liaisons H de type Hoogsteen mais c'est plus rare, on les trouve principalement dans des tRNA par exemple entre les boucles T PHI et D:  ou encore dans les pseudonoeuds:  Les structures secondaires de l'ARN permettent d'obtenir des molécules plus stables, ayant une structure tertiaire donnée, donc d'avoir une fonction catalytique donnée. PROPRIETES PHYSICO-CHIMIQUES
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ADN -> ADN
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réplication ou duplication
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ADN -> ARN
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transcription
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ARN -> protéines
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traduction
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ARN -> ARN
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cas des virus à ARN : permet la poursuite du cycle infectieux (grâce à l'ARN génomique) et fournit l'ARNm nécessaire au processus infectieux
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ARN -> ADN
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transcription réverse : nécessaire pour que l'information génétique puisse s'insérer dans l'ADN hôte.
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